Parabéns, a tua teoria está bastante bem abordada!
Concordo também com o que disse o Admin e o Terriermon.
O meu ponto de vista, é que em Tamers, Dobermon presenteou os escolhidos esse mesmo programa conversor de que falou o Kaiser.
Imaginemos...o ficheiro Takato.hmno (hmno=humano) e Guil.mon.
Esse programa iria converter o .hmno para um ficheiro compatível com o .mon, fazendo com que se pudessem fundir, tal como fizeram, imaginemos, em Adventure 02 com a Digivolução DNA, em que dados de dois digimons, com o mesmo formato, se podiam juntar. Ou seja, de certa forma, acaba por ser parecido.
Em Digimon Frontier, como já disse o Kaiser, eram os Espíritos Digitais que faziam a conversam do .hmno directamente para .mon
Agora, em XrosWars, digamos que há outro tipo de fusão de dados, todos do tipo .mon, que usam o programa/update DigiXros para realizar uma fusão parcial, criando uma armadura em volta do digimon principal.
De qualquer forma, uma muito boa teoria. Parabéns! :D